通古斯族语言属于阿尔泰语系。是世界语言分类阿尔泰语系下的一个分支。日语是否属于阿尔泰语系存在争议。日语和阿尔泰语系、南岛语系都有密切的关系，受汉语影响很大，吸收了本来作为汉藏语系特点的声调和量词，因此使日语的语言学归属变得十分复杂。语言学家对于日语的起源存在不同的意见。许多学者认为，从句法上说，日语接近诸如土克曼语和蒙古语之类的阿尔泰语系语言。日语在句法上与朝鲜语相似是得到广泛认可的。也有证据表明，日语词法和词汇在史前受到南面的马来－波利尼西亚语系语言的影响。日本语系，是部分学者提出的一个语系，包含日语族和琉球语族两大分支。不过，日本语系中的成员（即日本语和琉球语）的分类仍然存在争议，有些学者将它们划归为阿尔泰语系或南岛语系，而有些学者则认为它们是孤立语言。